Sinonasal cancer: In-depth genetic analysis of patients for personalized treatment and disease monitoring

Sintesi progetto

I carcinomi naso-sinusali sono un gruppo di tumori rari spesso difficili da classificare. Nonostante un miglioramento negli anni recenti delle possibilità di trattamento, permane una elevata frequenza di recidiva e la sopravvivenza a 5 anni è bassa (20-60%).
Ipotesi. La caratterizzazione genetica di queste neoplasie può migliorare la loro classificazione e fornire indicazioni su possibili nuovi bersagli terapeutici. La ricerca di alterazioni genetiche nel DNA circolante può consentire di monitorare la risposta alla terapia e di identificare precocemente eventuali riprese di malattia. Scopi dello studio. Identificare le alterazioni genetiche presenti nei carcinomi naso-sinusali e verificare in modelli preclinici la possibilità di utilizzo di farmaci specifici contro questi bersagli. Monitorizzare la risposta al trattamento attraverso la ricerca di queste mutazioni nel DNA circolante ed attraverso la identificazione di marcatori tumorali tramite biosuperfici diagnostiche.
Metodi. Un analisi preliminare retrospettiva di Whole Exome Sequencing (WES) condotta 50 casi di carcinoma naso-sinusale servirà alla identificazione di un pannello di geni alterati, che sarà poi testato su ulteriori 150 casi. Le alterazioni della espressione delle corrispondenti proteine sarà quindi testata su microarray tissutali di carcinoma naso-sinusale. Test di funzionalità di molecole dirette contro i bersagli molecolari individuati saranno condotti su colture cellulari tridimensionali. Biosuperfici diagnostiche saranno quindi costruite tramite stampa a microcontatto per il riconoscimento dei biomarcatori tumorali identificati. Campioni ematici raccolti al momento della diagnosi, dopo il trattamento e durante il follow-up saranno analizzati per la presenza dei biomarcatori identificati precedentemente allo scopo di monitorare il decorso della malattia.
Risultati attesi e potenziale impatto. La caratterizzazione genetica di queste neoplasie rare consentirà un miglioramento del loro inquadramento e potrà fornire nuove opzioni terapeutiche per un trattamento personalizzato. Indagini non invasive su campioni ematici potranno migliorare la gestione dei pazienti. 

Linea di intervento: Linea 3.6

Costo progetto: euro 600.000,00

Contributo Regione Toscana: euro 480.000,00

Durata:  36 mesi

Coordinatore

•  Università di Pisa - Dipartimento di Ricerca Traslazionale – Prof. Alessandro Franchi

Partecipanti

• AOU PISANA
• Istituto Neuroscienze – CNR
• AUSL TOSCANA CENTRO
• AUSL TOSCANA SUD EST

Costo progetto UNIPI: euro 190.000,00

Contributo Regione Toscana UNIPI: euro 152.000,00