A seguito dell'accordo politico di aprile 2019, la Commissione europea ha avviato la definizione del piano strategico pluriennale, che collega il programma specifico di Horizon Europe con i programmi di lavoro che conterranno le call per i primi 4 anni di Horizon Europe, già in corso di definizione.

Il documento elaborato, “Orientations towards the first Strategic Plan implementing the research and innovation framework programme Horizon Europe”,  stabilisce gli orientamenti strategici per l’investimento europeo in ricerca e innovazione per il periodo 2021-2024, in linea con le priorità politiche della Commissione, gli orientamenti strategici per perseguirli (Key Strategic Orientation – KSOs) e gli impatti attesi (Impacts), concentrandosi sul II pilastro "Sfide globali e competitività industriale europea" e le sue sei tematiche cluster, oltre che sulla parte del programma relativa all'ampliamento della partecipazione e al rafforzamento dello Spazio Europeo della Ricerca. Identifica inoltre le missioni ed i partenariati europei, mentre le sinergie tra Horizon Europe e gli altri programmi europei e la strategia per la cooperazione internazionale vengono definiti in una fase successiva.Delinea, infine, gli aspetti trasversali al programma quali genere, etica, Open Science, Dissemination & Exploitation.