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Nei suoi quasi settecento anni di vita l’Università di Pisa ha raccolto nei suoi 10 musei, a scopo didattico o di studio, un vasto e variegato patrimonio storico, scientifico e artistico.

Nove musei si trovano nella città di Pisa e costituiscono il Sistema Museale di Ateneo. Il Museo di Storia Naturale si trova a Calci ed è un centro autonomo di Ateneo.

Musei del Sistema Museale di Ateneo

• Collezioni Egittologiche
• Gipsoteca di Arte Antica
• Museo Anatomico Veterinario
• Museo degli Strumenti per il Calcolo
• Museo della Grafica
• Museo di Anatomia Patologica
• Museo di Anatomia Umana
• Orto e Museo Botanico
• Museo degli Strumenti di Fisica

Vai al sito del Sistema Museale di Ateneo

Museo di Storia Naturale dell’Università di Pisa

Il Museo di Storia Naturale dell’Università di Pisa è uno dei più antichi musei al mondo. Nato alla fine del XVI secolo come “Galleria” annessa al Giardino dei Semplici di Pisa (l’attuale Orto Botanico), il Museo ha sede presso la suggestiva Certosa di Pisa a Calci.
Vai al sito del Museo

• Centro interuniversitario di ricerca " Incontri di culture:trasmissione di testi dal greco al siriaco all'arabo al latino "
• Centro interuniversitario di ricerca e consulenza genetica del cane
• Centro interuniversitario di studi e ricerche storico-militari
• Centro interuniversitario di agronomia ambientale e agroclimatologia CIAAA
• Centro interuniversitario di ricerca " Centro studi di politica comparata Giovanni Sartori" ( ex CIRES) 
• Centro interuniversitario di ricerca sull'inquinamento da agenti fisici CIRIAF
• Centro interuniversitario per la storia finanziaria italiana CIRSFI
• Centro interuniversitario di ricerca sulla storia degli insegnamenti linguistici CIRSIL
• Centro interuniversitario per la storia delle università italiane CISUI .
• Centro interuniversitario di sistemi integrati per l'ambiente marino ISME
• Centro di ricerca per la comunicazione e l'apprendimento informale della matematica MATEMATITA
• Centro interuniversitario " Biblioteca italiana digitale " CIBID
• Centro interuniversitariodi storia culturale CSC
• Centro interuniversitario di ricerca sulla storia delle città toscane CIRCIT
• Centro interuniversitario di ricerca sul turismo CIRT
• Centro di ricerca "Ennio De Giorgi"
• Centro interuniversitario di ricerca e formazione sul servizio civile
• Centro Interuniversitario di ricerca sulla nautica CIRN
• Centro Interuniversitario per lo studio sulla crescita e lo sviluppo economico ( CICSES )
• Centro Interuniversitario di ricerca CLAVIER
• Centro Interuniversitario di ricerca e servizi sulle tecnologie e l'ingegneria dei veicoli 
• Centro Interuniversitario di ricerca e servizi sulla statistica avanzata per lo sviluppo Equo e Sostenibile - ASESD 
• Centro Interuniversitario di ricerca Queer ( CIRQUE)
• Centro interuniversitario di ricerca sull'invecchiamento sano ed attivo ( C.R.I.S.A.)
• Centro interuniversitario di ricerca di storia marittima e navale ( CISMEN )
• Centro interuniversitario "Documentazione sul Pensiero Economico Italiano ( CIPEI)
• Centro interuniversitario per la promozione dei principi delle 3R nella didattica e nella ricerca ( CENTRO 3R)
• Centro interuniversitario di adattabilità dei sistemi zootecnici ai cambiamenti climatici ( ASIZOCACLI )
• Centro interuniversitario di ricerca per lo sviluppo sostenibile CIRPS
• Centro interuniversitario di ricerca sul cambiamento politico CIRCAP
• Centro interuniversitario Economia Sperimentale CIES
• Centro interuniversitario per le ricerche in vulcanologia CIRVILC
• Centro interuniversitario di ricerca biodiversità vegetale BIG - DATA PLANT DATA 
• Centro interuniversitario di studi Italo - Iberici  ( ITIBER) 
• Centro interuniversitario in Ricerca Clinica 
• Centro studi su Ambiente e Società dell' Appennino 
• Centro interuniversitario di ricerca "Ecologia Politica e Società "EPS 
• Centro interuniversitario di Sociologia Politica CIUSPO 
• Centro studi sul Diritto e le Scienze dell' Agricoltura Alimentazione e Ambiente "CEDISA"
• Centro di ricerca interuniversitario Foscolo (CRIF) 
• Centro interuniversitario di ricerca "Letteratura Scientifica in latino dal medioevo all'età moderna "SCI.L.LA"
• Centro interuniversitario per la Ricerca e lo sviluppo della Public History ( CISPH) 
• Centro interuniversitario RES Viva, ricerche epistemologiche e storiche sulle scienze del vivente